مقاله تحقیقات بیماریهای عفونی، بیوانفورماتیک و اومیک ها

تحقیقات بیماریهای عفونی، بیوانفورماتیک و اومیک ها

Omics, Bioinformatics, and Infectious Disease Research

نیاز برای بیوانفورماتیک

اگرچه بیوانفورماتیک، به طور کلی تصور می شود یک علم مدرن می باشد، این اصطلاح بیش از سی سال قبل توسط پائولین و بن هسپر برای مطالعه فرآیندهای انفورماتیک در سیستم های زنده مطرح شده است. این لزوما مبهم است بیوانفورماتیک سرچشمه بسیاری از رشته ها است و می تواند تعداد زیادی معنی داشته باشد. در واقع می توان استدلال نمود که مقایسه و تجزیه و تحلیل داده ها از رشته های مختلف، بینش هایی را ارائه می دهد. در زمینه ژنومیکس و رونویسی، بیوانفورماتیک یک میدان فوق العاده متنوع است. تکامل، اپیدمیولوژی، محیط زیست و پاسخ یک ارگانیسم به محیط زیستش، همه زمینه هایی هستن که نیاز به بیوانفورماتیک برای دقت پردازش و مکان گذاری درون منابع مختلف مفهومی داده ها دارد. در قلب ژنومیکس و ترانس کریپتومیکس، تولید و تجزیه و تحلیل مقادیر عظیمی از داده-های توالی وجود دارد. تعیین توالی DNA در اواخر دهه 1980صورت گرفت وقتی که سیستمهای زیستی، اولین دستگاه توالی خودکار را توسعه داده است. توسعه بعدی، راه های کارآمدتر برای دنباله در رشد فوق العاده تعدادی از توالی سپرده در بانک ژنی را منجر شده است. بدیهی است، با بیش از 100 میلیون توالی ذخیره شده در بانک ژنی، آن برای انجام هر کار جدی با یک مجموعه داده های بزرگ عملی نیست. اطلاعات به دست آمده از ترتیب سنج تولید ثانویه 1000 برابر بزرگ تر از ترتیب سنج های مبتنی بر مویین است. آن در حال حاضر امکان برای تولید بسیاری از گیگابازهای داده های توالی را فراهم ساخته است. بیوانفورماتیک ها همراه با ساختن حس آن و استخراج آن، ذخیره سازی آن، انتشار آن و حصول اطمینان از نتیجه گیری معتبر می باشد که نتیجه ان ترسیم می شود....

پروتئومیکس

علیرغم این واقعیت که ژنوم یک گونه به خوبی می تواند بزرگتر از محتوای ژنوم عضوی از گونه ها به دلیل مفهوم پان ژنوم باشد، پروتئوم ارگانیسم تا حد بسیار زیادی پیچیده است. همانطور که قبلا بحث شد، ترانس کریپتومی آشکار شده که زیرمجموعه ای از ژنوم است تحت شرایط معین بیان می شود. با این حال، تغییرات بعد از انتقال پروتئین ها، پروتئوم فعلی را به مراتب پیچیده تر از رونویسی می سازد. این مساله از قدرت پروتئومیکس برمیاید، به همین نحودر یک مطالعه از انگل داخل سلولی اجباری Chlamydia pneumonia دیده شده است. C. pneumonia مسبب شایع سوم عفونت های تنفسی در جهان است، که، تا یک اندازه، با توجه به چرخه زندگی دو مرحله ایمنحصر به فرد پاتوژن باکتریایی امکان پذیر است. گسترش کلامیدیا از طریق یک ذره عفونی از نظر سوخت و ساز بی اثر که نهاده بنیادی نامیده می شود صورت می گیرد. این نهاده ابتدایی وارد سلول میزبان شده در جایی که در بدنه مشبک، متمایز می شود .